En 1950, une quinzaine de congrégations Saint Joseph, ayant toutes pour fondateur le Père Jean-Pierre Médaille (1610-1669), décident de travailler ensemble et ultérieurement se constituent en Fédération.

Vers 1985, il se fait sentir le besoin de créer un groupe de religieuses et de laïcs plus particulièrement chargé de la formation et de l'animation dans le domaine de l'Education.

Dans les années 2000, avec l’accord de la Fédération Saint-Joseph, il est décidé de créer une association, type loi 1901, et les statuts sont déposés en Préfecture du Rhône le 7 août 2000.

Le Président de l'Association reçoit mission de la Présidente de la Fédération Saint-Joseph, autorité de tutelle de Saint-Joseph Formation Animation.

 Saint-Joseph Formation Animation est l'organisme de formation au service du réseau scolaire Saint-Joseph  qui comprend établissements, soit 131 unités pédagogiques du 1er degré et 53 du second degré, répartis sur 20 départements. Cela représente environ 35 000 élèves et 4 500 enseignants et personnels.

L'organisme de formation a  plus particulièrement développé un partenariat privilégié avec la tutelle Saint Joseph de Lyon qui compte 16 écoles – 10 collèges – 8 lycées – 4 enseignements supérieurs – 1 institut de jeunes sourds - 1 institut International (Suisse) - 1 Institut (Belgique) et En co-tutelle le collège et le lycée St Joseph de GAP

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